Bioinformatique, modélisation

En réponse avec l’objectif 13 du 3e Plan Cancer définissant les moyens nécessaires à une recherche innovante, notamment pour la caractérisation du génome des tumeurs et pour la modélisation des processus tumoraux, cet axe nouvellement créé pour la période 2015-2017 permettra de regrouper les acteurs fondamentaux de la bio-informatique, des mathématiques appliquées et du traitement des données.

L’axe regroupera les chercheurs et ingénieurs de la plateforme impliqués sur la plateforme bio-informatique de la Fondation Synergie Lyon Cancer, mise en place en 2009 avec un soutien du CLARA et les chercheurs du centre de recherche de l’Institut de Recherche en Informatique (INRIA) Grenoble-Rhône-Alpes, qui développe des programmes appliqués dans le domaine de la santé, en particulier dans la modélisation des essais cliniques en cancérologie.

Les activités de ce nouvel axe viseront à soutenir le développement de nouveaux modèles numériques de la croissance tumorale et de l’efficacité thérapeutique, à établir des guidelines pour la modélisation des données cliniques, à favoriser l’accès au séquençage de nouvelle génération ainsi qu’à développer ou participer à des projets d’envergure en oncologie (par exemple, la plateforme bio-informatique participe actuellement au programme ICGC ainsi qu’au programme du SIRIC de Lyon de profilage génétique des tumeurs, PROFILER).

Un groupe de travail sera mis en place permettant de favoriser les interactions pluridisciplinaires entre cliniciens, chercheurs biologistes et avec des sociétés savantes régionales en mathématique appliquée (comme la Fédération Lyonnaise de Modélisation et Sciences Numériques ou la Société des Mathématiques Appliquées et Industrielles), qui proposent du conseil ou l’accès au calcul intensif pour des projets générateurs de compétitivité. La coordination de l’axe sera déterminée à l’issue des premières réunions de ce groupe de travail.

Référent : Pascal ROY (Hospices Civils de Lyon, Université de Lyon)

Contact CLARA : Arnaud CUTIVET, Chargé de mission Animation Scientifique & Structuration – 04 37 90 17 14


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