Workshop SIMONCO : Statistique, Informatique, Modélisation pour l’Oncologie – 27 juin 2016, Lyon

Event date: on 27 juin 2016

Premier rendez-vous du groupe « Bioinformatique et modélisation en cancérologie » du CLARA, l’atelier SIMONCO a réuni près de 70 personnes. Occasion unique de rassembler les communautés régionales issues de la bioinformatique, de la biostatistique et de la biomathématique, cette journée avait pour objectifs de décloisonner entre ces disciplines, de valoriser les expertises scientifiques régionales et d’encourager de nouvelles collaborations.

La journée a commencé par le point de vue du clinicien avec la participation du Dr. Mary CALLANAN du CHU Grenoble Alpes. Découpé en 3 sessions, le programme a ensuite alterné des conférenciers invités (Emmanuel BARILLOT, Stefan MICHIELS, Dirk DRASDO) qui ont apporté leur éclairage dans ces domaines, et des présentations scientifiques des équipes régionales.

Téléchargez les présentations :

Point de vue du clinicien

Mary CALLANAN – Personalised (Epi)Genomic Diagnostics and Theranostics in Clinical Oncology / Haematology : Opportunities, Challenges and Future Perspectives

Session Bioinformatique

Aurélie GABRIEL – Amplification of Oncogenes: Evaluation of the Break-Fusion-Bridge Mechanism Footprints in NGS Data

Tiffany DELHOMME – Needlestack: A Highly Scalable and Reproducible Pipeline for the Detection of ctDNA Variants Using Multi-Sample Deep Next Generation Sequencing Data

Laurent GUYON – Network Based System Analysis for microRNAs in Cancer: Identifying Putative Tumor Suppressor microRNAs and oncomiRs

Bertrand DE MEULDER – Building Molecular handprints: a Systems Biology Approach to Complex Diseases

Session Biostatistique

Stefan MICHIELS – Utilisation des signatures dans les essais cliniques en oncologie

David COX – Data Driven Disease Screening and Prevention – Breast Cancer Example

Pascal ROY – Méthode statistique pour la comparaison de pipelines utilisés dans le séquençage à haut débit

Emmanuelle DANTONY – Optimism Bias Correction in Omic Studies: Assessment of Penalized Methods on Simulated Data

Session Biomathématique

Dirk DRASDO – Agent-Based Multiscale Modeling of Tumors and Tissues: From Histological Data to Models and Back

Fabrice KWIATKOWSKI – What Selection Pressure Does to Mutations Favouring Cancer: A Monte-Carlo Approach

Emmanuel GRENIER – Population Approaches Applied to Glioma Growth

Christophe ARPIN – Mathematical Modeling of Memory CD8 T Cell Ontogeny and Quantitative Prediction

Le comité d’organisation :

  • Yves-Jean BIGNON, Centre Jean Perrin
  • Pascal ROY, Hospices Civils de Lyon
  • Nicolas THIERRY-MIEG, TIMC-IMAG
  • Alain VIARI, Plateforme Gilles Thomas de bioinformatique
  • Arnaud CUTIVET, Cancéropôle CLARA

Workshop-SIMONCO-06-2016_2_web

Le 27 juin 2016

Workshop SIMONCO : Statistique, Informatique, Modélisation pour l’Oncologie – 27 juin 2016, Lyon

Event date: on 27 juin 2016

Premier rendez-vous du groupe « Bioinformatique et modélisation en cancérologie » du CLARA, l’atelier SIMONCO a réuni près de 70 personnes. Occasion unique de rassembler les communautés régionales issues de la bioinformatique, de la biostatistique et de la biomathématique, cette journée avait pour objectifs de décloisonner entre ces disciplines, de valoriser les expertises scientifiques régionales et d’encourager de nouvelles collaborations.

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Le 27 juin 2016


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