Formation en ligne du mercredi 19 janvier au mardi 2 mars 2021
Dans la suite logique des formations en bioinformatique organisées depuis 2014, le Cancéropôle Île-de-France propose depuis début 2021 un MOOC “NGS & CANCER” aux chercheurs académiques franciliens, impliquées dans un ou plusieurs projets de recherche en cancérologie.
Cette formation en ligne que vous pourrez suivre à votre rythme pendant 6 semaines a pour objectif de vous initier à l’analyse de données RNA-seq avec R Studio, en prenant l’exemple de l’analyse de l’expression différentielle de gènes. Un cours d’approfondissement de 1 ou 2 jours, facultatif, permettra à un nombre limité de personnes de revenir sur certains points de la formation, appliqués à leurs données.
Date limite d’inscription : 29 novembre 2021.
Le MOOC a les objectifs suivants :
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- apprentissage des bases théorique des analyses NGS et du traitement des données RNA-seq issues de séquençage haut débit
- mise à niveau sur l’utilisation de R Studio et sur les méthodes statistiques
- initiation pratique à l’analyse de données RNA-seq avec R Studio pour l’étude de l’expression différentielle de gènes
Il vous demandera 4 à 5 heures de travail par semaine, que vous pourrez organiser à votre rythme. Les cours seront mis en ligne de manière hebdomadaire entre le 19/01 et le 02/03 et se présenteront sous la forme de vidéos et documents, de quizz permettant de vérifier votre compréhension et, le cas échéant, d’exercices de mise en pratique sous R Studio.
Un cours d’approfondissement de 1 ou 2 jours en avril, facultatif, permettra à un nombre limité de personnes de revenir sur certains points de la formation, appliqués à leurs données.
Au programme :
- Semaine 1 et 2 : Introduction aux NGS et traitement initial des données
- Semaine 3 et 4 : Introduction à R : bases R et R Studio
- Semaine 4 et 5 : Introduction aux statistiques appliquées aux analyses RNAseq
- Semaine 5 et 6 : Analyse de l’expression différentielle des gènes
Les frais de formation sont pris en charge par le Cancéropôle Île-de-France.
Programme détaillé et inscriptions
