MOOC NGS & Cancer – Single Cell

Depuis 2023, le Cancéropôle IDF propose une formation en ligne dédiée à l’analyse de données de type single cell transcriptomique.

Cette formation en ligne que vous pourrez suivre à votre rythme pendant 9 semaines a pour objectif de vous initier à l’analyse de données Single Cell avec R Studio, en prenant l’exemple de l’analyse de données single cell RNAseq short read. Un cours d’approfondissement d’un jour, facultatif et réservé aux chercheurs franciliens, permettra à un nombre limité de personnes de revenir sur certains points de la formation, appliqués à leurs données.

Objectifs

  • Apprendre les bases théorique des analyses NGS et du traitement des données de type single cell
  • Acquérir le vocabulaire et les notions nécessaires pour dialoguer de manière plus efficace avec les bioinformaticiens en charge des analyses
  • Vous initier de manière pratique à l’analyse de données Single Cell avec R Studio, en prenant l’exemple de données RNAseq short read.

Remarque : Un cours dédié à l’analyse de données RNAseq de type bulk sur le même format est proposé de manière distincte. Toutes les informations sont accessibles sur la page dédiée.

Public concerné : Chercheurs biologistes travaillant dans le domaine du cancer, en poste dans un laboratoire académique et débutants en bio-informatique. Dans le cadre d’un partenariat entre cancéropôles, l’inscription est ouvert aux professionnels issus de laboratoires académiques français.

Prérequis : Aucun prérequis n’est nécessaire. Une prise en main du logiciel R Studio et une mise à niveau sur les bases théoriques concernant les analyses NGS sont inclus dans le programme de la formation.

Calendrier et modalités d’inscription

  • INSCRIPTIONS OUVERTES JUSQU’AU 9 JANVIER 2026.
  • Dates de la formation : du 28 janvier au 31 mars 2026.
  • Formation MOOC sur 9 semaines / 4 chapitres, demandant 4 à 5 heures de travail par chapitre, à réaliser en autonomie et à son rythme (formation asynchrone).
  • Cours d’approfondissement d’une journée : session de format “classique” avec des formateurs (formation synchrone), limitée à 20/30 participants franciliens.

Les frais de formation sont pris en charge par les Cancéropôles.

/!\ Les participants à la session d’approfondissement devront faire signer à leur employeur une convention de formation. Ils devront avoir suivi le MOOC dans son intégralité.

/!\ Les personnes dont l’inscription à l’approfondissement est validé s’engagent à être présents cette journée de formation. Les désistements de dernière minute occasionnent des frais non négligeables et mettent en péril la bonne organisation de futures sessions.

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